MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Citrobacter koseri ATCC BAA-895 plasmid pCKO2

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009794	GAA	3	9	14	22	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149317
2	NC_009794	TCG	2	6	28	33	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149317
3	NC_009794	A	8	8	35	42	100 %	0 %	0 %	0 %	157149317
4	NC_009794	AGG	2	6	88	93	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149317
5	NC_009794	CCG	2	6	101	106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149317
6	NC_009794	GGA	2	6	159	164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149317
7	NC_009794	T	6	6	189	194	0 %	100 %	0 %	0 %	157149318
8	NC_009794	CAG	2	6	223	228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149318
9	NC_009794	CTG	2	6	229	234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149318
10	NC_009794	TGC	2	6	335	340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149318
11	NC_009794	AAC	2	6	361	366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149318
12	NC_009794	CGG	2	6	393	398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149318
13	NC_009794	GGT	2	6	426	431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149318
14	NC_009794	GAT	2	6	502	507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149318
15	NC_009794	GGC	2	6	533	538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149319
16	NC_009794	GCCGG	2	10	542	551	0 %	0 %	60 %	40 %	157149319
17	NC_009794	CTG	2	6	560	565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149319
18	NC_009794	GGA	2	6	613	618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149319
19	NC_009794	GGC	2	6	804	809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149319
20	NC_009794	CTG	2	6	842	847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149319
21	NC_009794	TAC	2	6	869	874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149319
22	NC_009794	GTG	2	6	914	919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149319
23	NC_009794	GC	4	8	964	971	0 %	0 %	50 %	50 %	157149319
24	NC_009794	CCTCG	2	10	1042	1051	0 %	20 %	20 %	60 %	157149319
25	NC_009794	CAC	2	6	1120	1125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149319
26	NC_009794	AGC	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149319
27	NC_009794	CGGA	2	8	1152	1159	25 %	0 %	50 %	25 %	157149319
28	NC_009794	GCA	3	9	1241	1249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149319
29	NC_009794	GCC	2	6	1338	1343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149319
30	NC_009794	CTG	2	6	1449	1454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149319
31	NC_009794	TGC	2	6	1606	1611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149319
32	NC_009794	AGC	2	6	1744	1749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149319
33	NC_009794	CAG	2	6	1752	1757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149319
34	NC_009794	ACT	2	6	1759	1764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149319
35	NC_009794	GAGC	2	8	1847	1854	25 %	0 %	50 %	25 %	157149319
36	NC_009794	CAG	2	6	1872	1877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149319
37	NC_009794	TGGCCG	2	12	1935	1946	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	157149319
38	NC_009794	GCA	2	6	1969	1974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149319
39	NC_009794	GGT	2	6	2156	2161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009794	TTG	2	6	2162	2167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009794	A	7	7	2263	2269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009794	ACT	2	6	2287	2292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009794	T	7	7	2299	2305	0 %	100 %	0 %	0 %	157149320
44	NC_009794	T	7	7	2346	2352	0 %	100 %	0 %	0 %	157149320
45	NC_009794	AT	3	6	2469	2474	50 %	50 %	0 %	0 %	157149320
46	NC_009794	ATT	2	6	2511	2516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009794	T	6	6	2515	2520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009794	TGCT	2	8	2588	2595	0 %	50 %	25 %	25 %	157149321
49	NC_009794	TGA	2	6	2607	2612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149321
50	NC_009794	GGA	2	6	2706	2711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149321
51	NC_009794	TTA	2	6	2712	2717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149321
52	NC_009794	CAG	2	6	2723	2728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149321
53	NC_009794	CTG	2	6	2732	2737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149321
54	NC_009794	GTG	2	6	2750	2755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149321
55	NC_009794	ACG	2	6	2863	2868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149322
56	NC_009794	TGC	2	6	2902	2907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149322
57	NC_009794	TG	3	6	2988	2993	0 %	50 %	50 %	0 %	157149322
58	NC_009794	GCC	2	6	3023	3028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149322
59	NC_009794	CGC	2	6	3041	3046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149322
60	NC_009794	T	6	6	3078	3083	0 %	100 %	0 %	0 %	157149323
61	NC_009794	ACA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149323
62	NC_009794	TAT	2	6	3099	3104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149323
63	NC_009794	ACTA	2	8	3117	3124	50 %	25 %	0 %	25 %	157149323
64	NC_009794	CAG	2	6	3156	3161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149323
65	NC_009794	TAA	2	6	3197	3202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149324
66	NC_009794	ATA	2	6	3225	3230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149324
67	NC_009794	ATC	2	6	3254	3259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149324
68	NC_009794	AGC	2	6	3263	3268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149324
69	NC_009794	TAC	2	6	3278	3283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149324
70	NC_009794	GTA	2	6	3407	3412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149324
71	NC_009794	CT	3	6	3516	3521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009794	ATA	3	9	3615	3623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149325
73	NC_009794	AGC	2	6	3646	3651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149325
74	NC_009794	TA	3	6	3681	3686	50 %	50 %	0 %	0 %	157149325
75	NC_009794	TTC	2	6	3721	3726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149325
76	NC_009794	TTC	2	6	3761	3766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149325
77	NC_009794	TAAT	2	8	3780	3787	50 %	50 %	0 %	0 %	157149325
78	NC_009794	T	6	6	3833	3838	0 %	100 %	0 %	0 %	157149325
79	NC_009794	TGT	2	6	3860	3865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149325
80	NC_009794	TGT	2	6	3918	3923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149325
81	NC_009794	TAA	2	6	3937	3942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149325
82	NC_009794	A	6	6	3995	4000	100 %	0 %	0 %	0 %	157149325
83	NC_009794	TGC	2	6	4045	4050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149325
84	NC_009794	A	6	6	4084	4089	100 %	0 %	0 %	0 %	157149325
85	NC_009794	TATTT	2	10	4119	4128	20 %	80 %	0 %	0 %	157149326
86	NC_009794	CGT	2	6	4129	4134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149326
87	NC_009794	CAT	2	6	4166	4171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149326
88	NC_009794	TAA	2	6	4177	4182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149326
89	NC_009794	ATCT	2	8	4187	4194	25 %	50 %	0 %	25 %	157149326
90	NC_009794	T	6	6	4201	4206	0 %	100 %	0 %	0 %	157149326
91	NC_009794	TTC	2	6	4313	4318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149326
92	NC_009794	TAA	2	6	4348	4353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149326
93	NC_009794	TTCT	2	8	4432	4439	0 %	75 %	0 %	25 %	157149326
94	NC_009794	C	6	6	4452	4457	0 %	0 %	0 %	100 %	157149326
95	NC_009794	T	6	6	4469	4474	0 %	100 %	0 %	0 %	157149326
96	NC_009794	AGG	2	6	4520	4525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149327
97	NC_009794	ATG	2	6	4543	4548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149327
98	NC_009794	GATG	2	8	4591	4598	25 %	25 %	50 %	0 %	157149327
99	NC_009794	TCT	2	6	4638	4643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149327
100	NC_009794	T	7	7	4652	4658	0 %	100 %	0 %	0 %	157149327
101	NC_009794	A	6	6	4687	4692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009794	TC	4	8	4835	4842	0 %	50 %	0 %	50 %	157149329
103	NC_009794	TA	3	6	4844	4849	50 %	50 %	0 %	0 %	157149329
104	NC_009794	GCT	2	6	4864	4869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149329
105	NC_009794	GTCC	2	8	4889	4896	0 %	25 %	25 %	50 %	157149329
106	NC_009794	GAT	2	6	4910	4915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149329
107	NC_009794	GCA	2	6	4932	4937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149329
108	NC_009794	G	6	6	4950	4955	0 %	0 %	100 %	0 %	157149329
109	NC_009794	CCGAG	2	10	4994	5003	20 %	0 %	40 %	40 %	157149329
110	NC_009794	CAG	2	6	5008	5013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149329
111	NC_009794	GCC	2	6	5111	5116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149328
112	NC_009794	GA	3	6	5118	5123	50 %	0 %	50 %	0 %	157149328
113	NC_009794	TCC	2	6	5158	5163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149328
114	NC_009794	CGC	2	6	5229	5234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_009794	CGCC	2	8	5301	5308	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_009794	GAG	2	6	5345	5350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009794	AGG	2	6	5594	5599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.